2 октября 2002 года в городе Чолпон-Ата был подписан протокол намерений между правительством Республики Кыргызстан и делегацией Сибирского федерального округа Российской Федерации во главе с полпредом Президента РФ в СФО Леонидом Драчевским.
В ходе переговоров между делегациями достигнута договоренность о содействии сторон развитию и активизации торгово-экономического, научно-технического и гуманитарного сотрудничества по актуальным проблемам, представляющим взаимный интерес между администрациями областей Кыргызской Республики и регионами СФО, а также прямых связей между хозяйствующими субъектами и организациями на основе прямых договоров.
Также намечено углубление взаимовыгодного сотрудничества и расширение прямых межрегиональных связей регионов СФО и Киргизии в области культурно-гуманитарных и научно-образовательных отношений, а также между научными и учебными заведениями, национальными творческими коллективами, расширение обменов студентами и аспирантами. В частности, в Бишкеке планируется открыть филиал Томского политехнического университета.
Стороны договорились к 1 февраля 2003 года обменяться информацией о ходе выполнения данного протокола.
Протокол намерений подписали премьер-министр Кыргызской Республики Николай Танаев и полномочный представитель Президента РФ в Сибирском федеральном округе Леонид Драчевский.
Помимо этого также был подписан ряд протоколов между субъектами СФО - Омской и Томской областями и областями Кыргызской Республики - Иссык-Кульской, Ошской, Чуйской и Джалал-Абадской.